2011年年初以來，人們已經發現了150頭以上粘滿石油的海豚，其中一半都是幼海豚。NOAA指出，其中至少八頭身上的原油已經被確定為來來自BP的油井，另外單是從3月中旬以來已經發現了87只死亡的海龜(都是瀕危品種)。
喬伊說：“對我來說，所謂這是偶然結果的說法完全是廢話，但令人憤怒的是，人們已經花了無數的力氣來鼓吹：‘一切順利，到2012年事情將完滿解決’。”
還有一些研究對喬伊的發現提出了質疑。勞倫斯·伯克利國家實驗室的科學家特里·哈森在油井被封閉六周后，盡管并沒有追蹤到深水區的石油，但他發現了自然產生的噬油細菌存在的證據。德克薩斯A&M大學的科學家約翰·克斯勒則發現與石油一起泄漏出的大量甲烷氣體也在迅速減少。
但是喬伊對此并沒有感到困擾。在她的實驗室里，技師們幾個月里一直忙著做實驗，以便掌握更多石油在沉入海底后的分解情況。她說：“微生物們并不高興，它們并沒有對石油進行代謝，我們都認為它們應該在大快朵頤，實際上它們并沒有。這是為什么呢？我不知道，但我們進行了許多種不同的組合實驗，力圖找出規范它們行為的因素。”
當去年第一篇關于深水地平線漏油事故的報告出臺時，喬伊由于后背的勞損不得不臥床休息。但同時她的團隊的一部分人正在距離油井幾公里的地方(乘坐著該地區唯一的一艘考察船)，并且把油井向天空噴射火焰的照片貼在了網上。喬伊說，在最早的那些天，她只有一個念頭，那就是要更多的考察船到現場去看看石油究竟怎么樣了。
對科學家們來說，漏油事故發生后的頭幾周是他們最為沮喪的一段時間。BP公司和政府官員們極端不愿對漏油總量進行任何估計。奧巴馬總統任命的一個調查委員會后來對那些嚴重低估漏油量的官員進行了嚴厲的批判。
獨立科學家們高喊著要求數據。喬伊十分幸運，她已經安排好了一次考察，而其他科學家只是重復使用這次考察的結果而已。他們發現水中懸浮著大團的油滴，并且立刻在考察隊的網頁上進行了更新，完成了測量。結果引起了人們的震驚。
BP總裁托尼·海沃德只是簡單地否認深水中有石油的存在.。他說：“石油都是在水面上的，”在對路易斯安那的清理指揮中心進行短暫的視察期間，他對記者說：“海水里一點油都沒有。”
政府的反應更加令人失望。美國海洋及大氣管理局局長簡·盧布琴科(她本人也是一位海洋科學家)公開表示完全沒有明確的證據說深海有石油。“我們必須保證我們不會貿然得出結論，”她在接受PBS電視臺采訪時說。(美國當局后來承認在海面下有“低濃度”的石油存在)
在鏡頭之外，喬伊和其他科學家遭到了來自憤怒的官員、NOAA和其他政府機構的電話轟炸。她說：“我覺得自己就好像是一個小學三年級學生，老師拿尺子打了一下我的手，并且說：‘你剛才亂說話了。’他們非常煩惱。”
其他科學家都表示，喬伊和政府科學家之間的沖突是因為這次漏油事故的極端嚴重性。其規模之大、持續時間之長都是科學家們從未經歷過的，因此他們說其中有巨大的不確定性。爭論的雙方都有可能被證明是正確的，但喬伊將拿出一些證據。
喬伊說：“我是那種如果相信什么就會拿出180%證據來證明它的人。我熱愛墨西哥灣，我熱愛生態系統，這就是我為什么一直堅持做自己所做事情，堅持說自己在說的話的原因。如果我看到了證明自己觀點錯誤的證據，我會改變觀點的。”
但是，她又說：“迄今我還沒有看到任何能夠讓我改變觀點的證據。”
漏油事故后果
150頭——自從2011年初以來被沖上岸的死海豚數。
87只——三月中旬以來發現的死海龜數。
36億——去年BP公司向那些受漏油事故影響的人們賠付的款項(美元)，比200億美元的賠償基金總額低得多。
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